本校自105學年首創跨域學程，建立跨域彈性學分機制與豐富化模組課程，提供本校大學部學生提出申請，以畢業學分不增加（或僅有少量增加）的前提下進行，並以生活學習社群及彈學導師制度為後援，提供學生更大的彈性學習空間，也為國家培育具國際移動力的跨領域人才。
跨域學程修業流程
跨域學程完修後，畢業證書加註
學程資訊：https://cross.web.nycu.edu.tw/info/
跨域學程模組課程必修科目表：https://cross.web.nycu.edu.tw/points/
學分組成範例：跨域學程本系A表+跨域模組B表+校必修(依各系規定)
雙主修、輔系、學分學程與跨域學程的差異
| 名稱 | 畢業學分數 | 證書方式 |
|---|---|---|
| 雙主修 | 需修畢主學系最低畢業科目學分及加修學系全部專業（門）必修科目學分，比主學系最低畢業學分數至少多35學分以上。詳細應修學分請依各學系規定。 | 畢業證書載明兩個系（班）授予雙學士學位。 |
| 輔系 | 輔系應修學分數以20學分為原則，比主學系最低畢業學分數至少多20學分以上。詳細應修學分請依各學系規定。 | 畢業證書加註輔系名稱。 |
| 學分學程 | 學分學程應修學分數以18學分為原則(12~50學分)，畢業學分以原系規定之畢業學分為原則。 | 畢業證書不予加註，另外取得學分學程證書。 |
| 跨域學程 | 校必修、原學系的基礎必修課程、原學系的跨域模組課程，以及另外一個學系或研究所或學院的跨域模組課程(28~32學分)，畢業學分以原系規定之畢業學分為原則。 | 畢業證書加註第二專長模組課程為「跨域專長」。 |
多方資源教學增能計畫
彈學導師制度
各學程導師查詢：https://cross.web.nycu.edu.tw/teacher/
小班補充教學
申請表格連結：https://cross.web.nycu.edu.tw/supplemental-instruction/